La cantidad de agua producida por los sistemas de purificación de los laboratorios, en ocasiones es insuficiente para la demanda que deben suplir, por lo que se utiliza el almacenamiento de agua pura (tipo II), para la producción de agua ultrapura (tipo I). 

La producción de agua y el mantenimiento de un sistema de purificación de agua, deberían ser procesos sencillos. No obstante, si no se ha seguido una práctica de mantenimiento adecuada, es posible que se conviertan en un problema. De manera particular, el aspecto vinculado con la producción de agua, es importante, debido a que los estándares de calidad del agua para el laboratorio son estrictos. Es necesario que los sistemas de purificación de agua puedan cubrir los requerimientos de estos estándares, de manera consistente y en el volumen adecuado.

Primeramente, todos los equipos e instrumentos de laboratorio, están expuestos a ser contaminados por microorganismos, algo que no puede suceder si se desea un uso correcto de acuerdo a las normativas sanitarias que deben practicarse dentro de estos espacios. Es importante no confundir la limpieza con la esterilización, los cuales son procesos que pueden combinarse pero que cuentan con características distintas que es preciso señalar.